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一.保稅物流加工貿(mào)易貨物進出口報關(guān)的許可證管理
1.進口料件，除易制毒化學品、監(jiān)控化學品、消耗臭養(yǎng)層特質(zhì)、原油、成品油等國家規(guī)定商品外，均可以免予交驗進口許可證。
2.成出口成品，屬于國家規(guī)定應(yīng)交驗許可證的，在出口報送時必須交驗出口許可證。
二.保稅物流加工貿(mào)易進出環(huán)節(jié)的稅收征管
1.進口關(guān)稅和進口環(huán)節(jié)稅：準予保稅進口的加工貿(mào)易料件，進口環(huán)節(jié)暫緩繳納關(guān)稅和進口環(huán)節(jié)稅（如增值稅、反段銷稅等）。
2.出口關(guān)稅：
加工貿(mào)易項下出口應(yīng)該稅商品，如系全部使用進口料件加工生產(chǎn)的產(chǎn)品，不征收出口關(guān)稅。
加工貿(mào)易項下出口應(yīng)稅商品（包含出口邊角料及殘次品）如系部分使用進口料件、部分使用國內(nèi)采購料件加工貿(mào)易的產(chǎn)品，則按海關(guān)核定的比例征收出口關(guān)稅。具體計算公式如下：出口關(guān)稅＝出口貨物完稅價格X出口關(guān)稅率X(出口產(chǎn)品中使用的國產(chǎn)料件價值/全部料件的價值）
－特別提醒：出口貨物的完稅價格由海關(guān)根據(jù)《中華人民共和國海關(guān)審定進出口貨物完稅價格辦法》的規(guī)定審核確定。企業(yè)應(yīng)在向海關(guān)備案或交更登記手冊（最遲在成品出口前）時，向海關(guān)如實申報出口成品中使用的國產(chǎn)料件占全部料件的價值比例。
三.保稅物流加工貿(mào)易出口的特殊商品的稅收征管
加工貿(mào)易貿(mào)易出口的特殊商品應(yīng)征出口關(guān)稅的，按照有關(guān)規(guī)"規(guī)定辦理。例如:
1.加工貿(mào)易出口的末鍛鋁，按一般貿(mào)易出口貨物從價征收出口關(guān)稅；
2.加工貿(mào)易出口屬于列名的服裝，從量征出口關(guān)稅。
四.其他加工貿(mào)易貨物的處理
其他保稅物流加工貿(mào)易貨物是指履行加工貿(mào)易合同過程中產(chǎn)生的剩余料件、邊角料、殘次品、副產(chǎn)品和受災(zāi)保稅貨物。
對于屬于加工貿(mào)易合同過程中產(chǎn)生的上述剩余料件、邊角料、殘次品、副產(chǎn)品和受災(zāi)保稅貨物，企業(yè)必須在登記手冊有效期內(nèi)處理完畢。處理的方式有內(nèi)銷、結(jié)轉(zhuǎn)、退運、放棄等。
－－特別提醒：無論何種處理方式，企業(yè)必須填制報送單、選擇相應(yīng)貿(mào)易方式報送，進口或出口貨物報送單是報核的必要單證。
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